MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 1680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011758	AGC	2	6	208387	208392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011758	CGG	2	6	208474	208479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011758	CAG	2	6	208480	208485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011758	CAA	2	6	208517	208522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011758	CGC	2	6	208554	208559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_011758	CGC	2	6	208578	208583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_011758	C	6	6	208586	208591	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1008	NC_011758	GCC	2	6	208603	208608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_011758	CGGAT	2	10	208615	208624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_011758	GC	3	6	208627	208632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_011758	TGC	2	6	208673	208678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011758	GC	3	6	208677	208682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_011758	GC	3	6	208767	208772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011758	ACG	2	6	208799	208804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011758	AGCGT	2	10	208825	208834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_011758	CGCC	2	8	208901	208908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1017	NC_011758	TCCG	2	8	208945	208952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_011758	AAG	2	6	208957	208962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011758	GCC	2	6	208969	208974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_011758	CTG	2	6	209011	209016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011758	ACG	2	6	209031	209036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011758	CGC	2	6	209058	209063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_011758	TGC	2	6	209096	209101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011758	CGA	2	6	209163	209168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011758	ACC	2	6	209174	209179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_011758	GC	3	6	209181	209186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_011758	GCG	2	6	209228	209233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011758	TGA	2	6	209240	209245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011758	AC	3	6	209273	209278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_011758	CGGG	2	8	209304	209311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_011758	GCC	2	6	209346	209351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_011758	CGA	2	6	209373	209378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011758	CAG	3	9	209401	209409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011758	GTT	2	6	209415	209420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011758	CAC	2	6	209428	209433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011758	GCT	2	6	209441	209446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011758	GCC	2	6	209549	209554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_011758	CCG	2	6	209568	209573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_011758	CGA	2	6	209582	209587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011758	GGC	2	6	209698	209703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011758	GAG	2	6	209711	209716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011758	GTG	2	6	209735	209740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011758	CGA	2	6	209749	209754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011758	GGC	2	6	209805	209810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011758	AGC	2	6	209811	209816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011758	CGC	2	6	209824	209829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011758	CCT	2	6	209988	209993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_011758	CGC	2	6	210004	210009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_011758	CCG	2	6	210036	210041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_011758	CGCCT	2	10	210173	210182	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1051	NC_011758	CGC	3	9	210184	210192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_011758	CTG	2	6	210209	210214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011758	ACCGGC	2	12	210238	210249	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_011758	CGA	2	6	210274	210279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011758	TCC	2	6	210292	210297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_011758	AAC	2	6	210309	210314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011758	CG	3	6	210347	210352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_011758	CCA	2	6	210377	210382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_011758	GTG	2	6	210405	210410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011758	GGC	2	6	210412	210417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011758	GGCC	2	8	210602	210609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011758	C	6	6	210647	210652	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_011758	GCT	2	6	210686	210691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011758	GACC	2	8	210695	210702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011758	ACG	2	6	210750	210755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011758	GGC	2	6	210779	210784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011758	AGG	2	6	210787	210792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011758	CGG	2	6	210793	210798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011758	CTA	2	6	211431	211436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011758	GTT	2	6	211446	211451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011758	CACC	2	8	211503	211510	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1072	NC_011758	GAG	2	6	211511	211516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011758	GCTC	2	8	211525	211532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_011758	GA	3	6	211552	211557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011758	ATCT	2	8	211605	211612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_011758	ACA	2	6	211768	211773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011758	GAT	2	6	211821	211826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011758	AT	3	6	211825	211830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011758	AT	4	8	211834	211841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011758	TTGCA	2	10	211924	211933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_011758	CTT	2	6	211940	211945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011758	TGA	2	6	212062	212067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011758	GTGG	2	8	212092	212099	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011758	TAGA	2	8	212146	212153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011758	CACG	2	8	212176	212183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_011758	CCGG	2	8	212211	212218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011758	TCTTG	2	10	212231	212240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_011758	GC	4	8	212244	212251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_011758	TTG	2	6	212284	212289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011758	GCC	2	6	212364	212369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_011758	AT	3	6	212403	212408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011758	GGA	2	6	212425	212430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011758	GAG	2	6	212492	212497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011758	TTC	2	6	212517	212522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011758	GTA	2	6	212579	212584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011758	TGG	2	6	212636	212641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011758	GGCT	2	8	212752	212759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_011758	CCA	2	6	212804	212809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_011758	CG	3	6	212836	212841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_011758	TTC	2	6	212847	212852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011758	AAG	2	6	212940	212945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011758	ATG	2	6	212978	212983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011758	ACA	2	6	213081	213086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011758	GAC	3	9	213172	213180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011758	GCC	2	6	213207	213212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_011758	TCG	2	6	213216	213221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011758	GCG	2	6	213229	213234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011758	GGC	2	6	213256	213261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011758	GAAGC	2	10	213286	213295	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_011758	GCG	2	6	213405	213410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011758	TAG	2	6	213454	213459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011758	GCG	2	6	214458	214463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011758	TTC	2	6	214549	214554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011758	CAAC	2	8	215395	215402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_011758	TGCC	2	8	223764	223771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_011758	AAAT	2	8	223977	223984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011758	GCA	2	6	224035	224040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011758	AGA	2	6	224191	224196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011758	GGA	2	6	224281	224286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011758	CGAA	2	8	225517	225524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_011758	TGC	2	6	225585	225590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011758	GGC	2	6	225629	225634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_011758	AGG	2	6	237279	237284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011758	GCCCG	2	10	237291	237300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1125	NC_011758	AACCGC	2	12	240222	240233	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_011758	GCC	2	6	240252	240257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_011758	C	6	6	240272	240277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1128	NC_011758	GTG	2	6	241647	241652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011758	CG	3	6	241681	241686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_011758	GTT	2	6	241692	241697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011758	CGT	2	6	241700	241705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011758	GT	3	6	241724	241729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011758	CGA	2	6	241787	241792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011758	CG	3	6	241805	241810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_011758	TCA	2	6	241831	241836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_011758	CCG	2	6	241840	241845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_011758	CCGG	2	8	241975	241982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_011758	G	6	6	242071	242076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_011758	GCGG	2	8	242102	242109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1142	NC_011758	CCGC	2	8	242196	242203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1143	NC_011758	CGGCG	2	10	242204	242213	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1144	NC_011758	GAGGG	2	10	242411	242420	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_011758	G	6	6	242418	242423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_011758	CGA	2	6	242525	242530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_011758	GC	3	6	242622	242627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1154	NC_011758	GGCG	2	8	242692	242699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1155	NC_011758	GAT	2	6	242747	242752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_011758	CGT	2	6	242819	242824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1160	NC_011758	GC	3	6	242853	242858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1161	NC_011758	CT	4	8	242873	242880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1169	NC_011758	CGG	2	6	243139	243144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1197	NC_011758	TCG	2	6	247588	247593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_011758	AG	3	6	259856	259861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_011758	CAC	2	6	261098	261103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_011758	GCCC	2	8	261108	261115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1265	NC_011758	CGG	2	6	261127	261132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_011758	CAG	2	6	261140	261145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_011758	GCC	2	6	306723	306728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1407	NC_011758	GCG	2	6	313288	313293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_011758	TCC	2	6	313296	313301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_011758	CGGG	2	8	313404	313411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_011758	TGA	2	6	313418	313423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_011758	CG	4	8	313433	313440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_011758	TCGC	2	8	319736	319743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_011758	CCTTGC	2	12	319760	319771	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1415	NC_011758	GCG	2	6	319804	319809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_011758	GAG	2	6	319833	319838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_011758	CTTTA	2	10	321902	321911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1425	NC_011758	CAT	2	6	322275	322280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1433	NC_011758	GCC	2	6	322595	322600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1434	NC_011758	GCC	2	6	322690	322695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1439	NC_011758	TCC	2	6	322902	322907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1440	NC_011758	CAG	2	6	322908	322913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_011758	AAG	2	6	323050	323055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_011758	ATT	2	6	323135	323140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_011758	AT	5	10	323194	323203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_011758	CTT	3	9	323213	323221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_011758	CCT	2	6	323326	323331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1448	NC_011758	CAA	2	6	324814	324819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_011758	TGA	2	6	324837	324842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_011758	CGG	2	6	324976	324981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_011758	CGC	2	6	325030	325035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1454	NC_011758	CTGA	2	8	325060	325067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1455	NC_011758	ACCTG	2	10	325149	325158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1481	NC_011758	CGAG	3	12	335053	335064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1483	NC_011758	CGAA	2	8	335148	335155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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